Donquichote Doflamingo est l'un des sept Corsaires ; son ancienne mise à prix était de 340 millions de berrys. Il croit que la piraterie entre dans une nouvelle période où les rêveurs n'ont plus leurs places et où les légendes telles que le One Piece n'ont plus d'intérêt. Ses idées ont d'ailleurs ralié à lui de nombreux pirates, comme l'équipage de Bellamy ou anciennement Law.
Dans l'histoire, il était présent il y a 24 ans lors de l'éxecution de Gol D Roger. Plus tard, il intervient pour châtier Bellamy, qui a osé perdre contre Luffy et ainsi déshonorer son drapeau. On apprend ensuite qu'il est le chef des ventes d'esclaves sur l'archipel Sabaody (autrement dit, le chef de Disco a qui il léguera la boutique suite à « l'incident Sabaody »). On le revoit en terre sainte (à Marie-Joie) avec quatre autres Capitaines corsaires se préparant à la guerre contre Barbe Blanche. Durant la bataille qui s'ensuit, il déclare que seul le vainqueur de cette guerre déterminera quel est la justice à appliquer dans ce monde. Néanmoins, on le voit intervenir seulement à partir du moment où Oz Jr. qui est membre de l'équipage de Barbe Blanche entre en action. Il lui tranche la jambe avec une facilité déconcertante (probablement grâce à son pouvoir) il semble aussi avoir déjà rencontré Crocodile puisqu'il lui propose pour la deuxième fois lorsque ce dernier affrontait Joz de rentrer sous ses ordres.
À la fin de la bataille, on voit Doflamingo et quelques Pacifistas affronter Gecko Moria avec l'intention de le tuer. Ce dernier demande si l'ordre vient de Sengoku mais Doflamingo lui réponds que l'ordre vient de "plus haut".
Après l'ellipse, on apprend que c'est lui qui tire les ficelles à Punk Hazard,sous le pseudonyme de "Joker". Il fait passer les enlèvements des enfants pour des accidents grâce à la base G-5 de la marine. Le vice-amiral Vergo, chef de la base, est en fait un ancien pirate à son service, il se charge de corrompre les soldats du G-5. On ignore encore quel plan il prépare, mais il est certain qu'il cherche à s'emparer de la mystérieuse "clé" enfermée dans l'île dont parlait Law. .
C'est un personnage très étrange dont on ne sait pas exactement les limites, mais il fait partie des pirates les plus dangereux du monde. Il est également cruel, impitoyable et n'a aucun scrupule à tuer ceux qu'il sait plus faibles que lui.